Avogadro ist ein plattformunabhängiges Programm zum Erstellen von 3D Molekülen für Computerchemie, Molekulardesign, Bioinformatik, Materialwissenschaften und verwandte Gebiete. Es nutzt das Qt-Toolkit zur Darstellung der Benutzeroberfläche, OpenGL um die Moleküle darzustellen und Open Babel, einer Bibliothek für verschiedene Speicherformate chemischer Strukturen. Unterstützt werden verschiedene Algorithmen zur Berechnung von Molekularmechaniken, die Generierung von Eingabeparametern für die Computer-Chemie Software GAUSSIAN und GAMESS (US), die Erstellung kristallographischer Elementarzellen und die Darstellung von Isoflächen und Molekülorbitalen.[1]